Los cambios conformacionales a nivel de la estructura de la cromatina a escala de un dominio génico constituyen uno de los primeros niveles de regulación epigenética que contribuyen a la activación de un gen o grupos de genes, en tiempo y espacio. En la presente propuesta de investigación adoptamos al grupo de genes alfa-globina de pollo como sistema biológico modelo. Este locus génico está compuesto por tres genes; el gen embrionario pi, y los genes adultos alfaD y alfaA que se expresan diferencialmente durante el desarrollo del pollo con la finalidad de generar distintas hemoglobinas en respuesta a los diferentes requerimientos de oxígeno del organismo. Este proyecto se enmarca, en parte, como la continuación del apoyo DGAPA-PAPIIT anterior (IN203811) donde trataremos de redondear los resultados preliminares que hemos obtenido y abordar nuevas preguntas. En esta propuesta de proyecto de investigación planteamos que la conformación regulada de un dominio cromatínico tiene un impacto directo en la expresión génica. La función de distintos tipos de RNAs no-codificantes, como los RNA largos no-codificantes y los enhancer RNAs (eRNAs), al igual que remodeladores de la cromatina como la proteína ATRX son necesarios para adoptar una configuración óptima de la cromatina que permita la expresión regulada de los genes alfa-globina de pollo. Con base a esta hipótesis planteamos tres objetivos generales: 1) El estudio de un RNA no-codificante que se transcribe a lo largo del enhancer 3' del dominio y que pudiera tener propiedades de eRNA contribuyendo en la actividad del enhancer 3'; 2) Proseguir con la caracterización del RNA largo no-codificante (SDIT) que hemos descrito en el locus alfa-globina de pollo, además de plantear nuevas preguntas para empezar a entender sus mecanismos de acción: y 3) Retomaremos el estudio de la proteína remodeladora de la cromatina ATRX desde la perspectiva de su contribución en la organización del dominio alfa-globin y su efecto regulatorio sobre la expresión de los genes globina. Con base a estas preguntas seguiremos profundizando en el entendimiento del papel que tiene la estructura de la cromatina como proceso inicial dentro de la cascada de eventos que llevan a la expresión diferencial de los genes alfa-globina de pollo.

Planteamiento del Problema Los cambios conformacionales a nivel de la estructura de la cromatina a escala de un dominio génico constituyen uno de los primeros niveles de regulación a nivel epigenético que contribuyen a la activación de un gen o grupos de genes, en tiempo y espacio. Con base a los antecedentes previamente expuestos, en la presente propuesta de investigación nos interesa evaluar la contribución de dos tipos distintos de RNAs no-codificantes y de la proteína remodeladora de la cromatina ATRX en la formación del dominio alfa-globina de pollo y la expresión diferencial de los genes alfa-globina durante la diferenciación eritroide y el desarrollo. Contribución del Proyecto La presente propuesta de proyecto de investigación tiene un aspecto innovador central que tiene que ver con el nivel de regulación que proponemos estudiar para entender la expresión diferencial de un grupo de genes durante el desarrollo. Dicho nivel se relaciona con las etapas iniciales de cambios epigenéticos que llevan a adquirir una conformación óptima de la cromatina a una región genómica que será transcrita de manera regulada durante diferentes etapas del desarrollo de un organismo.