La familia de proteínas DUF642 es exclusiva de plantas y esta muy conservada desde gimnospermas. El analísis filogenético preliminar revela que se agrupan en cuatro clados. Las proteínas pertenecientes al clado A se han encontrado asociadas a la pared celular de células en suspensión y de tallo de Arabidopsis mientras que las del clado C y D son proteínas ancladas a glicosilfosfatidilinositol que se encuentran asociadas a la matriz extracelular. Experimentos hechos en nuestro laboratorio demostraron la interacción in vitro de os proteínas del clado A con una pectin metil esterasa. La participación de las proteínas del clado A en los procesos de osmocondicionamiento y germinación ha sido sugerido por varios investigadores. Nosotros hemos encontrado una expresión diferencial de estos genes en osmocondicionamiento natural y germinación. El estudio de la participación de las proteínas DUF642 en osmocondicionamiento natural y germinación tanto dicotiledóneas como en monocotiledóneas. De manera particular estudiaremos la participación de las proteínas de los clados A y B en el osmocondicionamiento natural y la germinación de Arabidopsis y de maíz. La información derivada de ambas aproximaciones nos permitirá diseñar experimentos bioquímicos para poder definir la función de esta familia de proteínas y establecer con precisión si esta familia esta involucrada en un proceso relacionado con la remodelación de la pared celular.

La información derivada de la secuenciación de genomas completos analizada desde la perspectiva filogenética y de evolución molecular permitirá determinar los aminoácidos característicos de cada uno de los linajes proteínicos y por lo tanto facilitará la inferencia de diferencias funcionales. Esta información nos permitirá diseñar experimentos bioquímicos para poder definir la función de esta familia de proteínas y establecer con precisión si esta familia esta involucrada en un proceso relacionado con la remodelación de la pared celular durante la germinación. Por otro lado, una vez establecidas las relaciones de ancestría común también será posible asociar eventos de diversificación génica y características particulares de las proteínas con características fenotípicas de los linajes de plantas, por ejemplo de cambios en la estructura de la pared celular. En particular, el estudio fisiológico de la participación de las proteínas DUF642 en osmocondicionamiento natural y germinación tanto en dicotiledóneas como en monocotiledóneas nos permitirá establecer tanto la función bioquímica como su papel en los procesos de osmocondicionamiento natural y germinación. La contribución más importante de este proyecto es establecer, de una manera integral tomando en cuenta los aspectos bioquímicos, fisiológicos y evolutivos, la función de la familia DUF642 específica de plantas.