Durante más de medio siglo, una de las metas principales de la bioquímica de proteínas ha sido tratar de entender como los amino ácidos de una proteína determinan su función y también definen otras características bioquímicas y biofísicas que podemos medir. Unas de estas características son su susceptibilidad a inhibidores de su actividad o su capacidad de plegarse y replegarse. Estos fenómenos son muy complejos y, hasta ahora, la identificación de cuales amino ácidos son los responsables de este tipo de fenómenos se ha buscado de manera desordenada y aleatoria con muy poco éxito. Muchas veces también, se ha tratado de adjudicarle todo el efecto a un solo amino ácido. Aunque a veces, ese tipo de experimentos funcionan, la mayor parte de las veces no es así y hay un sinnúmero de fracasos de este tipo que casi nunca se reportan en la literatura científica. Esta propuesta describe, y quiere aplicar y perfeccionar, un método ordenado y sistemático para lograr esta identificación y así profundizar en el conocimiento de como ciertos amino ácidos afectan las propiedades globales de una proteína. Se han escogido como modelos las triosafosfato isomerasas de Trypanosoma brucei y Trypanosoma cruzi.

Este proyecto contribuirá con el diseño y su comprobación experimental de una nueva estrategia para identificar uno o más amino ácidos responsables de alguna función o propiedad biofísica de una proteína._x000D_ Mostrará que una forma ordenada y sistemática de abordar el problema, de realizar los experimentos y, en base a los resultados, realizar nuevas mutaciones, puede identificar a dichos amino ácidos y también encontrar interacciones de esos residuos a larga distancia, las cuales, muy difícilmente, o probablemente, nunca se hubieran encontrado haciendo mutagénesis dirigida al azar._x000D_ _x000D_ La estrategia propuesta en este proyecto es completamente original y nuestro grupo de trabajo ha sido lider en demostrar que los primeros pasos en la elucidación de las complejas correlaciones estructura-función para nuestra proteína modelo pueden ser conocidas como anticipábamos. La contribución de este proyecto será mejorar y completar la demostración citada.