Las infecciones del tracto urinario (IsTU) son una de las enfermedades infecciosas más comunes en humanos. Escherichia coli es el principal microorganismo causante de IsTU, dichas enfermedades tienen un costo económico y social alto para las comunidades y el sector hospitalario. Recientemente ha habido un alarmante incremento en la aparición de cepas de E. coli que son resistentes a los agentes antimicrobianos comúnmente usados, lo cual dificulta grandemente el tratamiento. Numerosos estudios han reportado un incremento sostenido de las tasas de resistencia de los uropatógenos a los antibióticos comúnmente prescritos (penicilinas, trimetoprima-sulfametoxazol, fluoroquinolonas y cefalosporinas). Esta resistencia usualmente se debe a la producción de enzimas ß-lactamasas de espectro extendido (ESBLs) por parte de las bacterias. Reportes epidemiológicos recientes informan sobre la diseminación a nivel mundial, especialmente en Europa, de cepas epidémicas de E. coli uropatogenas principalmente del grupo productor de ESBLS CTX-M-15. _x000D_ En México no se conoce con precisión la incidencia de las IsTU, sin embargo por datos extraoficiales sabemos que son muy frecuentes, y que cada vez es mas común aislar de infecciones urinarias cepas de E. coli multiresistentes a los antimicrobianos. Se desconoce si estas cepas multiresistentes pertenecen a grupos bacterianos clonales o linajes específicos de nuestra región geográfica (Ciudad de México) o si las bacterias son de otras regiones geográficas (otros países) y se diseminaron hasta nuestra ciudad. El objetivo del presente proyecto es caracterizar genotípicamente (tipificación molecular) cepas de E. coli uropatogenas multiresistentes de la Ciudad de México para conocer si dichas cepas pertenecen a grupos clonales o linajes de cepas epidemicas multidrogo resistentes como las reportadas recientemente en países de Europa, Canadá y Estados Unidos. Con el análisis de los resultados podremos detectar posibles brotes epidémicos de cepas multiresistentes causantes de infecciones del tracto urinario. Además tendremos una visión mas clara sobre las características genéticas de los grupos clonales bacterianos que les permitió diseminarse exitosamente en varios continentes. Para alcanzar dicho objetivo, las cepas se tipificaran con métodos moleculares tales como: Huella genómica bacteriana con la utilización del ensayo de Reacción en Cadena de Polimerasa (PCR) para encontrar en el ADN bacteriano consensos intergénicos repetitivos (del ingles ERIC2); para la subtificación se utilizará electroforesis en gel de campos pulsados (del ingles PFGE) y tipificación por secuencia de multilocus (MLST), además se determinará su grupo filogenético y el tipo de enzima ß-lactamasa que producen, además de conocer si la resistencia esta codificada en plásmidos o en el cromosoma bacteriano. Recientemente, aislamos en la Ciudad de México cepas de E. coli de pacientes con IsTU, y encontramos que muchas de estas cepas tienen numerosos factores de virulencia y el serogrupo (025:H4) característico que tienen las cepas epidémicas recientemente reportadas en Europa y Estados Unidos. Es muy importante conocer esto, para tomar medidas preventivas y evitar la diseminación de estas cepas en la población, y además mejorar el tratamiento medico de los pacientes con IsTU. La diseminación y prevalencia de las cepas de E. coli epidémicas tiene implicaciones importantes en la Salud Pública. _x000D_

La información resultante del presente proyecto es contribuir en la toma de medidas epidemiológicas útiles que prevengan la diseminación de cepas uropatogenas peligrosas en la población, ya que recientemente han surgido cepas que han mostrado ser altamente virulentas y difíciles de tratar debido a su multiresistencia a los agentes antimicrobianos. Los resultados del presente proyecto indicarán los perfiles de resistencia a los antimicrobianos que tienen las cepas uropatogenas de la Ciudad de México, esta información pude ser muy valiosa en la clínica ya que los tratamientos contra este tipo de infecciones generalmente son empíricos, esto se debe a la naturaleza de la enfermedad donde normalmente no se realizan pruebas de laboratorio tipo antibiograma. Sabemos que las bacterias uropatogenas de cada región responden de manera diferente a los antimicrobianos. Los resultados de esta investigación pueden servir de guía para un tratamiento antimicrobiano empírico más acertado, en beneficio del paciente._x000D_ Además se contribuirá al conocimiento de los mecanismos de patogenicidad de las cepas uropatogenas, con lo cual se pueden obtener datos para el posible desarrollo de métodos que permitan detectar o distinguir cepas uropatogenas de las cepas comensales de E. coli. A la fecha no se cuenta con un método de diagnóstico rápido y efectivo de las infecciones del tracto urinario. En general en México esta área de investigación es prácticamente inexistente._x000D_ _x000D_