En la actualidad se reconoce claramente la importancia de las enfermedades infecciosas en la salud pública, y en particular el gran riesgo que representan las enfermedades emergentes, causadas por la aparición de nuevos agentes infecciosos o por el aumento en la incidencia de agentes ya conocidos. En particular, desde su aparición en 1997, ha causado preocupación una cepa de influenza de origen aviar (H5N1) de alta virulencia para aves y humanos en Asia, la cual ha ampliado recientemente su distribución a varios países de Asia, África y Europa (1, 2, 5). La aparición de una nueva cepa de virus influenza H1N1 en marzo de 2009, la cual se ha transmitido por todo mundo, y ha causado primera pandemia de siglo XXI, mostró claramente la falta de métodos diagnósticos avanzados, capaces de identificar patógeno emergente no esperado (8). _x000D_ Las enfermedades respiratorias tienen gran impacto en salud publica, siendo la enfermedad infecciosa mas común reportada. Hay varios virus causantes de enfermedades respiratorias, entre los mas importantes son el Virus sincicial respiratorio, el virus de influenza, el virus de parainfluenza, los adenovirus y los coronavirus entre otros. El sistema de vigilancia y monitoreo de virus se lleva a cabo a través de los centros de referencia de cada país o región, sin embargo, en algunos lugares como México esta vigilancia resulta muy limitada, ya que hasta hace poco el diagnóstico se realizaba por inmunoensayos que utilizan anticuerpos que reconocen o antígenos comunes, o aislamientos virales en cultivo, metodos que en general tienen poca sensibilidad (4, 18). _x000D_ Para mantener una adecuada vigilancia epidemiológica de agentes infecciosos es fundamental fortalecer las capacidades de diagnóstico en nuestro pais. Una alternativa de diagnostico que se ha desarrollado recientemente es el uso de microarreglos que contienen oligonucleotidos capaces de detectar diferentes patogenos (6, 7, 20, 22). Uno de estos microarreglos con oligonucleotidos para la detección de virus (virochip) ha sido recientemente desarrolaldo en nuestro laboratorio. _x000D_ En este proyecto proponemos ampliar este virochip, que actualmente es capaz de detectar en un solo ensayo todos los agentes virales conocidos asociados a infecciones respiratorias. En este proyecto nos proponemos incrementar la capacidad diagnostica de este virochip para que pueda detectar diferencialmente los 8 genes de influenza y su origen animal, lo que ademas de diagnosticar nos permitiera monitorear la posible aparicion de nuevos virus rearreglantes._x000D_ El fundamento diagnóstico del virochip se basa en la hibridación de regiones específicas del genoma del patógeno (previamente amplificadas por RT-PCR a partir de las muestras clínicas) con los miles de oligonucleótidos presentes en el microarreglo, el cual está diseñado para identificar de manera diferencial al agente o agentes infecciosos presentes en la muestra. Este proyecto se llevará a cabo en el Instituto de Biotecnología (IBT) de la UNAM. En este proyecto se propone: 1. diseñar oligonucleotidos capaces de identificar especie de origen de todos los segmentos de virus influenza tipo A circulantes, 2. identificación de los virus causantes de enfermedades respiratorias, 3. identificación de surgimiento de posibles reareglantes entre virus influenza tipo A H1N1 2009 y virus influenza estacionales._x000D_

Durante este proyecto se diseñaran oligonucleotidos de 70 pares de bases, los cuales tendrán la capacidad de reconocer de manera especifica origen de todos los segmentos de virus influenza tipo A. Estos oligonucleotidos serán utilizados en conjunto con oligonucleotidos ya diseñados previamente para identificar y subtipificar todos los virus causantes de enfermedades respiratorias. El microarreglo diseñado de esta manera será utilizado para identificar virus respiratorios en muestras clínicas, para subtipificar los mas importantes y determinar posibles rearreglos en caso de identificar virus influenza tipo A. Los datos obtenidos durante este proyecto serán importantes para el sector salud, ya que por el momento se desconoce la prevalencia de los virus respiratorios en México. _x000D_